Dipende da cosa bisogna farci.
Per applicazioni base...potrebbero bastare i plugin dei vari Solidworks etc.
Credo che freeware esistono solo codici da implementare in matlab e cose simili,che alla fine,se non si e' un informatico,diventano piu' complessi del problema da risolvere.
Per il resto,ma credo gia' li conoscerai ci sono: CFX, Fluent, KIVA, NUMECA, Phoenics, STAR-CD, STAR-CCM+,Ansys etc..mi pare che STAR-CD,un tempo era open surce e freeware,poiche' finanziato dal governo USA.
Se vuoi qualcosa piu' simile a matlab c'e' SCILAB,che e' open surce.